知識產權海關保護備案，是指知識產權所有人，依照《知識產權海關保護條例》的規定，以書面形式在海關總署登記知識產權的法律狀態、相關貨物、知識產權的合法應用和侵權貨物的進出口，使海關能夠督進出口貨物的流程中自動保護相關知識產權。

自動進行海關備案的關鍵性體現在以下幾點上：

1、是海關采用自動保護辦法的前提

依據《條例》的規定，知識產權人未事先向海關備案的，海關發覺侵權貨物即將進出境，無權自動暫停進出口，也無權調查處置侵權貨物；

2、幫助海關發覺侵權貨物

雖然依據《條例》的規定，知識產權持有人在備案后仍需向相關海關申請保護辦法，但從實踐來看，海關是否能發覺侵權貨物主要取決于海關對相關貨物的檢討。

由于知識產權持有人在備案時需要提供知識產權的法律狀態、權力持有人的聯系方法、知識產權的合法應用、涉嫌侵權貨物、相關圖片和照片，海關可以在日常監視流程中發覺涉嫌侵權貨物并自動扣留。因此，提前備案知識產權可以及時保護權力持有人的合法權益；

3、知識產權人的經濟累贅較輕

依據海關總署有關《知識產權海關保護條例》的實行方法規定，在海關依職權保護模式下，知識產權權力人向海關提供的擔保更高不超過人民幣10萬元，同時還可以向海關總署申請總擔保。如果知識產權權力人事先未進行知識產權備案，則不能享受上述待遇，必需提供與其要求扣留的貨物等值的擔保；

4、可以震懾侵權人

由于海關沒收進出口侵權貨物，給予進出口企業行政處分，盡快備案知識產權，可以對過去進出口侵權貨物的企業發生警告和威懾作用，勉勵其有意識地尊敬相關知識產權。

此外，一些非惡意出口侵權產品的企業也可以通過查詢和記錄來了解合同加工和出口的貨物是否可能構成侵權。

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